qPCR Analyzer V3

多靶标标准曲线 · 加标回收率 · 可追溯质控 · 浏览器本地项目管理

● 数据仅保留在当前浏览器

本地实验项目

保存在当前浏览器,不上传云端

正在初始化
实验信息(将写入完整报告)
Absolute quantification

标准曲线与拷贝数计算

以 log10(已知拷贝数) 对 Ct 做线性回归,并反算未知样本拷贝数。

建议 ≥ 5 个梯度

样本与 Ct 数据

每个基因/检测项目分别建立曲线;Standard 填写拷贝数,Unknown / NTC 留空。不同项目可在同一图中叠加。

样本编号类型基因/检测项目拷贝数Ct 1Ct 2Ct 3Ct 4
支持 1–4 个复孔 · 双击任一 Ct 可排除/恢复该复孔
Relative quantification

2−ΔΔCt 相对定量

以同一样本的内参基因归一化,再与校准组比较;自动输出组别柱形图和误差。

假设扩增效率接近

样本、组别与双基因 Ct

每个样本填写目的基因和内参基因各 1–4 个复孔;NTC 不参与表达量计算。

样本编号样本类型组别目的 Ct1目的 Ct2目的 Ct3目的 Ct4内参 Ct1内参 Ct2内参 Ct3内参 Ct4
技术复孔先取均值 · 双击 Ct 可排除/恢复复孔
Efficiency-corrected normalization

双标准曲线相对定量

目的基因与内参基因分别建立标准曲线,先反算起始量,再完成归一化和组间比较。

适用于效率不一致

A. 两条标准曲线

同一梯度可同时填写目的基因与内参基因 Ct。

梯度编号起始量目的 Ct1目的 Ct2目的 Ct3目的 Ct4内参 Ct1内参 Ct2内参 Ct3内参 Ct4
双击任一 Ct 可排除/恢复该复孔

B. 待测样本与 NTC

输入待测样本或 NTC 的两种基因 Ct 复孔。

样本编号样本类型组别目的 Ct1目的 Ct2目的 Ct3目的 Ct4内参 Ct1内参 Ct2内参 Ct3内参 Ct4
双击任一 Ct 可排除/恢复该复孔
Reagent benchmarking

反转录酶与 qPCR 试剂评价

在相同样本、相同投入量和相同检测体系下,比较检出率、Ct、重复性、灵敏度与相对产出。

同条件横向比较

试剂对比数据

“投入量”可填写拷贝数、RNA 量或稀释倍数;NTC 不进入试剂性能汇总。

评价类型样本类型试剂/品牌样本投入量Ct 1Ct 2Ct 3Ct 4
灵敏度按检出率判定 · 双击 Ct 可排除/恢复复孔
Matrix spike recovery

加标回收率与加标曲线

按系列和检测项目配对未加标(或 NCS)与加标结果,计算单点回收率;多个加标水平可进一步拟合回收曲线。

独立流程 · 可复用标准曲线

基线、加标与 Ct / 实测值

“实测值”可直接填写浓度或拷贝数;若留空,则按同名检测项目在第 1 页的标准曲线由 Ct 自动反算。

系列/样本基因/检测项目角色加标量实测值Ct 1Ct 2Ct 3Ct 4
NCS / 未加标 / 加标 · 支持 1–4 个复孔 · 双击 Ct 可排除/恢复
Methods & quality control

使用说明、计算公式与判定逻辑

建议在正式分析前确认实验设计、阈值和对照设置;软件质控提示不能替代熔解曲线及扩增曲线人工审阅。

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标准曲线 / 绝对定量

使用已知起始量 x 与 Ct 建立 Ct = slope × log10(x) + intercept。软件按“基因/检测项目”分别拟合,可将多条曲线叠加在同一图,并在图内显示方程与 R²。

log₁₀(x) = (Ct − intercept) / slope
x = 10(Ct − intercept) / slope
Efficiency = (10−1/slope − 1) × 100%
dsDNA copies/µL = ng/µL × 10−9 × 6.022×1023 / (bp × 660)
原液 copies/µL = copies/反应 ÷ 模板加入量 × 稀释倍数
  • 每个检测项目至少 3 个不同浓度,建议 5–7 个梯度。
  • Unknown / NTC 的检测项目名称必须与对应 Standard 完全一致。
  • 建议 R² ≥ 0.98;本工具默认低于 0.95 判为风险。
  • 扩增效率通常以 90%–110% 为理想,工具默认 80%–120% 为可接受边界。
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2−ΔΔCt

先用内参校正样本间投入差异,再用校准组作为相对表达基线。

ΔCt = Cttarget − Ctreference
ΔΔCt = ΔCtsample − mean(ΔCtcalibrator)
Relative expression = 2−ΔΔCt
  • 目的与内参基因扩增效率应相近且接近 100%。
  • 校准组的组均值约为 1,但单个样本可上下波动。
  • 生物学重复先逐个计算,再进行组别汇总。
3

双标准曲线法

分别用两条回归方程将目的与内参 Ct 换算成起始量,不要求两者扩增效率完全一致。

Qtarget = 10(Cttarget−btarget)/mtarget
Qref = 10(Ctref−bref)/mref
Normalized = Qtarget / Qref

两条曲线都必须覆盖待测样本 Ct 范围;超出标准曲线范围的外推结果会单独预警。

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试剂评价

只有相同样本、投入量、引物和仪器条件的数据才能直接比较。反转录酶建议使用同一批 RNA;qPCR mix 建议使用同一批模板。

CV(Ct) = SD(Ct) / mean(Ct) × 100%
Detection rate = 有效 Ct 数 / 计划复孔数 × 100%
Relative yield = 2−(Ct−Ctbest matched) × 100%

推荐同时审阅扩增曲线、熔解曲线、NTC、标准品线性以及低浓度检出一致性。

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加标回收率

同一系列、同一检测项目内,用加标样的实测值扣除基线样实测值,再除以已知加标量。多个加标水平时,以加标量为 x、回收量为 y 拟合回收曲线。

回收量 = 加标样实测值 − 基线样实测值
回收率 (%) = 回收量 ÷ 加标量 × 100%
回收曲线:回收量 = slope × 加标量 + intercept
  • 基线可选择“未加标”或“NCS”,含义以试剂盒说明为准。
  • 实测值留空时,软件调用第 1 页同名检测项目的标准曲线由 Ct 反算。
  • 默认 80%–120% 仅为可编辑筛查范围,不替代方法学验证标准。
  • 公式参考:US EPA Method 1632A(Percent recovery = 100 × (A − B) / T)。
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本地项目管理

V3 使用浏览器 IndexedDB 保存多个实验项目,输入后约 0.7 秒自动保存。项目包含实验信息、阈值、所有原始 Ct、复孔排除标记和当前页面。

保存位置 = 当前浏览器 + 当前网站域名
云端上传 = 否
跨设备恢复 = 导出 / 导入 .qpcr-project.json
  • 更换浏览器、设备或网站域名时,本地项目不会自动同步。
  • 清理网站数据前,请先使用“导出项目”备份。
  • V3 可导入 V2 或 V3 的项目备份;V2 浏览器项目不会被自动覆盖。

默认质控规则(可在第一页修改)

复孔重复性SD > 0.50 Ct 或 CV > 2% 时预警;只有 1 个有效复孔时提示无法评价重复性。
人工排除双击 Ct 可排除或恢复复孔;被排除数值以删除线显示,并写入结果、质控和原始数据工作表。软件不会自动删除异常值。
NTC全部分析模块均可录入 NTC。NTC 有 Ct 且与最晚阳性样本间隔 < 3 Ct 时判为高风险;任何明确 NTC 扩增均建议检查污染/非特异扩增。
标准曲线R² < 0.95 或效率 < 80% / > 120% 判为高风险;正斜率无效。
加标回收率默认低于 80% 或高于 120% 判为风险;范围可在加标回收率页修改。
Ct 上限默认 Ct > 38 不纳入计算,可根据试剂、仪器和实验室 SOP 调整。
外推样本 Ct 超出标准曲线 Ct 范围时,结果保留但标记为外推风险。
Excel 报告模板和完整报告均为原生 .xlsx;报告分为实验信息、分析结果、质控、公式、原始数据和图表工作表。模板分类字段提供下拉选项。